Το 56ο Ατομικό Πρωτάθλημα Ελλάδας 2006 διεξήχθη από 27 Νοεμβρίου έως 5 Δεκεμβρίου 2006 στα Εκπαιδευτήρια Βασιλειάδη στην Θεσσαλονίκη με σύστημα πουλ απλών συναντήσεων και την συμμετοχή των εξής 10 σκακιστών:
Σπύρος Σκέμπρης, Θανάσης Μαστροβασίλης, Χρήστος Γκορίτσας, Θανάσης Καραγιάννης, Χριστόδουλος Μπανίκας, Βασίλης Κοτρωνιάς, Γιάννης Νικολαίδης, Δημήτρης Μαστροβασίλης, Σπύρος Καπνίσης και Βασίλης Κοτρότσος.

Πρωταθλητής Ελλάδας για το 2006 αναδείχθηκε ο Βασίλης Κοτρωνιάς τερματίζοντας μόνος πρώτος με 6.0/9, ενώ τη 2η και 3η θέση με 5.5/9 κατέλαβαν ο Θάνος Μαστροβασίλης και ο Σπύρος Σκέμπρης αντίστοιχα ύστερα από την άρση της ισοβαθμίας.

Οι συμμετέχοντες και οι συντελεστές του 56ου Ατομικού Πρωταθλήματος Ανδρών
Ο Πρωταθλητής Βασίλης Κοτρωνιάς	Θάνος Μαστροβασίλης (2η Θέση)	Σπύρος Σκέμπρης (3η Θέση)